Créé par décret en octobre 1942 sous la présidence d’Élie Lescot, le Corps d’Aviation est officiellement institué au sein des Forces armées d’Haïti le 9 septembre 1943, dans le cadre de l’engagement du pays aux côtés des Alliés durant la Seconde Guerre mondiale.
Les États-Unis, ayant besoin de partenaires pour patrouiller la mer des Caraïbes contre les sous-marins allemands, soutiennent activement l’initiative et cèdent au gouvernement haïtien six avions d’observation Douglas O-38E. Sa mission première est le transport, la communication et la surveillance maritime.
Six aviateurs haïtiens sont formés à la Tuskegee Army Airfield, en Alabama, entre 1943 et 1944, devenant les « Tuskegee Airmen haïtiens ». Le siège est établi à Bowen Field, à Port-au-Prince, ancien terrain d’aviation des Marines américains, qui restera la base aérienne principale du pays jusqu’en 1994.
Les premiers avions de combat, six North American F-51D Mustang, arrivent en 1950. Ils sont remplacés en octobre 1973 par des T-28D Trojan livrés par la France, puis par des O-2A Skymaster en 1975. Les premiers hélicoptères, dont des Sikorsky S-55 et S-58T, sont acquis en 1973 auprès des États-Unis. Faute d’entretien et de pièces, la flotte est en état de décrépitude à la chute de Jean-Claude Duvalier en 1986.
Dissous en 1994 avec l’ensemble des Forces armées après l’opération Uphold Democracy, le Corps d’Aviation est progressivement remobilisé à partir de 2017, avec une nouvelle base à Clercine. La modernisation de l’unité s’appuie sur la coopération de plusieurs pays dont l’Espagne, l’Argentine, le Mexique, la Colombie et Taïwan.

